موضوع یکپارچه کردن نیروهای پیشمرگه در اقلیم کردستان همچنان یکی از اصلی‌ترین اختلافات میان دو حزب دموکرات کردستان و اتحاد میهنی کردستان به‌شمار می‌رود و تلاش‌های دو طرف برای حل‌و‌فصل این موضوع بی‌نتیجه مانده است. بخشی از نیروهای پیشمرگه از حزب دموکرات و بخشی دیگر از حزب اتحاد میهنی هستند و در موارد بسیاری سیاست‌های حزبی موجب ناهماهنگی و اختلاف در سطوح فرماندهی و هماهنگی و حتی واریز حقوق نیروها می‌شود. به گونه‌ای که نیروهای پیشمرگه از حزب دموکرات از دستور فرمانده‌ای از حزب اتحاد میهنی اطاعت نمی‌کنند و برعکس.این شرایط در کنار افزایش فزاینده اختلافات در امور ریز و درشت، موجب شده است که برخی محافل از احتمال بروز درگیری مسلحانه در کردستان عراق میان نیروهای پیشمرگه سخن بگویند و سال‌های خونین «جنگ برادرکشی» (بین ۱۹۹۴ الی ۱۹۹۷) در یادها زنده شود.این اختلافات طی ماه‌های گذشته به حدی رسید که متیو مک فارلین، فرمانده ائتلاف آمریکایی ضد داعش در ماه مارس برای آرام کردن اوضاع وارد اربیل شد، هرچند تلاش‌های میانجیگری او نیز به نتیجه نرسید.