نبود نظارت کافی بر بازار تاریخی هنر اصفهان موجب شده تا شماری از بازاریان، جرزهای برخی مغازه‌ها را برای نصب بالابر و جانمایی صندوق بتراشند؛ ایجاد حفره، ارتعاش و تضعیف جرز دیوارها به گفته کارشناسان این بنای ۴۰۰ ساله را با خطر جدی تخریب روبه‌رو کرده است، آن هم در حالی که بازارچه بلند، یکی از بازارچه‌های زیبای صفوی در اصفهان است که در سال‌های پایانی دهه 40 احیا و در اختیار هنرمندان قرار گرفت، اما آن‌طور که شواهد نشان می‌دهد از مجموع ۸۰ حجره این بازار شاید سه یا چهار حجره دست نخورده یا کمتر دستکاری شده باقی مانده باشند.  در این بین اخیرا برخی مستاجران حجره‌ها، پا را فراتر گذاشته و با ایجاد حفره در پی و جرز طبقات اول و دوم این بازار 400 ساله اقدام به نصب بالابر کرده‌اند.
محمود درویش، عضو انجمن مفاخر معماری ایران درباره آنچه اصالت بازار هنر را تهدید کرده است به ایرنا می‌گوید: «در سال‌های اخیر تغییرات عجیب و غریبی در این بازار اتفاق افتاده است؛ از نصب تابلو بر سر در خوشنویسی شده بازار هنر تا جایگزینی درهای گره‌چینی و ویترین‌های چوبی با در و پنجره‌های فلزی بگیرید تا تراشیدن جرزها برای قرار دادن گاوصندوق‌ها و حالا هم چوب آخر را زده‌اند و با نصب بالابر در جرز دو طبقه بازار حفره ایجاد کرده‌اند.»
درویش در ادامه هشدار می‌دهد: «مستاجر در تمام قراردادهای اجاره حق هیچ‌گونه تغییر در معماری و فضای مورد استفاده را ندارد. مالک بازار هنر اوقاف است و بازاریان همگی مستاجر هستند، نظارت آثار تاریخی هم که به‌عهده میراث فرهنگی است!»