با وجود تمام پیش‌بینی‌ها و هشدارهای پیش از وقوع، این حادثه همچنان اثرات مخرب گسترده‌ای به دنبال داشت كه شاید مشابه آن فقط در سونامی سال 1389/2011 كه 20هزار كشته برجای گذاشت، مشاهده شده بود. تا لحظه تنظیم این گزارش شمار كشته‌شدگان این حادثه مخرب 30نفر  گزارش شده است. همچنین به گزارش نهادهای امداد و نجات 18 نفر در مناطق مختلف در اطراف توكیو مفقود شده‌اند و هنوز خبری از وضعیت سلامتی آنها در دسترس نیست. شمار مجروحان این حادثه كه به مراكز درمانی منتقل شده‌اند نیز تا لحظه تنظیم این متن 175 نفر گزارش شده است. برق حدود 270هزار خانه و جریان آب حدود ده‌هزار خانه دچار قطعی شده است كه مشكلات زیادی را برای شهروندان ژاپنی ایجاد كرده است. در حال حاضر 27هزار نیروی نظامی در كنار گروه‌های امداد و نجات و پلیس برای انجام كمك‌رسانی در حالت آماده‌باش قرار دارند. شهرداری توكیو نیز پناهگاهی را برای گردشگران خارجی در نظر گرفته است. گفته می‌شود نیروگاه هسته‌ای فوكوشیما نیز از شروع بارش‌های شدید چند پیام مشكل فنی به مركز خود ارسال كرده است كه بیشتر آنها به دلیل جریان آب ناشی از باران در این تأسیسات بوده و در دست بررسی قرار دارد. این نیروگاه پیشتر در زمان وقوع سونامی سال 89 نیز با اختلالاتی مواجه شده بود.
به‌دلیل طغیان رودخانه‌ها و همچنین بالاآمدن سطح آب دریا و امواج در برخی از نواحی ساحلی تا یك متر و همچنین افزایش 50 سانتی‌متری سطح آب در خلیج توكیو، مقامات رسمی احتمال وقوع سیل در شهر را هشدار داده بودند. از سوی دیگر هشدارهایی مبنی بر طغیان رودخانه‌ها و شكل‌گیری جریان‌های گل و لای نیز به شهروندان نواحی در معرض خطر ابلاغ شد. به همین علت از 45 میلیون شهروند ساكن شهرهای توكیو، كاناگاوا، سایتاما، گونما، یاماناشی و ناگانو خواسته شد در صورت امكان به پناهگاه‌های امن اعلام شده مراجعه كنند و در صورتی كه دسترسی آسانی به این پناهگاه‌ها ندارند به ساختمان‌های امن یا طبقات بالایی خانه‌هایشان بروند تا از خطر سیل در امان باشند. مقامات ژاپنی اعلام كرده‌اند تصمیم دارند آب‌های جاری شده در شهر را از سد شیرویاما (Shiroyama) در 50كیلومتری غرب توكیو خارج كنند تا احتمال وقوع سیل كاهش یابد و هرچه سریع‌تر شرایط زندگی شهروندان به حالت عادی بازگردد.