بنابر گزارش‌ها، هزینه جنگ، عامل مهمی بوده‌است که مقامات ایالات متحده در سال ۲۰۱۱ تصمیم گرفتند بخشی از نیروهای خود را در افغانستان و حتی بعدها بخش دیگری از آنها را در عراق کاهش دهند. برآورد متوسط هزینه اعزام تنها یک سرباز آمریکایی در افغانستان بیش از یک میلیون دلار آمریکا در سال است. در مارس ۲۰۱۹، وزارت دفاع ایالات متحده در گزارشی رسمی تخمین زده‌است که 592/737 میلیارد دلار در طول سال مالی ۲۰۰۱ تا سال مالی ۲۰۱۸ در افغانستان و به ازای هر مالیات‌دهنده آمریکایی ۳۷۱۴ دلار هزینه اشغالگری و کشتار در این کشور شده ‌است. با این‌حال تحقیقات دانشگاه براون رقم ۹۷۵ میلیارد دلار برای سال مالی ۲۰۰۱ تا سال مالی ۲۰۱۹ را به دست آورده‌ است. به عبارت بهتر، هر روز اشغالگری آمریکا تنها در کشور افغانستان، 300 میلیون دلار برای این کشور هزینه داشته است. همین میزان، درخصوص جنگ و اشغالگری در عراق نیز تخمین زده شده است.
براساس گزارش رسمی اخیر پنتاگون، برخی هزینه‌های جنبی نیز در این خصوص وجود دارد که نمی‌توان آنها را نادیده انگاشت. به عنوان مثال، هزینه چهار تا شش تریلیون دلار شامل هزینه‌های طولانی‌مدت پزشکی و از کارافتادگی برای اعضای خدمت، جبران سربازی و هزینه‌های اجتماعی و اقتصادی است. نکته مهم‌تر این‌که راه‌اندازی این جنگ، منجر به افزایش هزینه استقراض آمریکا از منابع بین‌المللی شده است. تا سال ۲۰۲۱، دانشگاه براون تخمین زده  که جنگ در افغانستان 261/2 تریلیون دلار هزینه داشته‌است که از این میان ۵۳۰ میلیارد دلار برای پرداخت سود و ۲۹۶ میلیارد دلار برای مراقبت از اشغالگران آسیب‌دیده آمریکایی هزینه شده‌ است.