بقایی با اشاره به این‌که ایران در تماس با مقام‌های ذی‌ربط افغانستان، اعتراض و نگرانی شدید خود رانسبت به تحدید نامتناسب آب‌های ورودی به ایران یا منحرف کردن مسیر طبیعی رودخانه‌های هر دو سوی مرزها ابلاغ کرده، تاکید کرد: از افغانستان انتظار می‌رود در استمرارجریان آب ازرودخانه‌های مرزی که ازسمت افغانستان به ایران جریان دارد،همکاری کرده و موانع ایجادشده رامرتفع کنند. بقایی در رابطه با ساخت یا آبگیری سدهای جدید در افعانستان وتاثیرات آن برمیزان آب ورودی به ایران، گفت: جمهوری اسلامی ایران بارها به طرق مقتضی به‌ویژه از مجاری دیپلماتیک رسمی و سازوکارهای کارکردی(فنی) به طرف‌های افغان تاکید کرده که بهره‌برداری از منابع و حوضه‌های آبی نمی‌تواند بدون رعایت حقوق ایران وفق معاهده‌های دوجانبه یا اصول و قواعد عرفی قابل اعمال و نیز اصل مهم حسن‌همجواری و همچنین ملاحظات زیست‌محیطی صورت گیرد.روز چهارشنبه مشاور آب وزارت انرژی و آب حکومت سرپرست طالبان ادعا کرد که آب‌های افغانستان را طوری مدیریت خواهد کرد که حقوق هیچ‌یک از کشورهای همسایه ضایع نشود اما پیشتر یک عضو کمیسیون امنیت ملی مجلس اواخر شهریور گفته بود که این‌  برنامه جدید سدسازی گروه طالبان افغانستان به قصد جلوگیری از ورود مختصر آب سیلابی به ایران انجام می‌شود.