آیت‌الله شیخ عیسی قاسم، در پیامی تاکید کرد: مجموعه تصمیم‌های صادرشده از سوی جریان سیاسی حاکم در بحرین مردود است. وی با اشاره به واکنش شیعیان به این تصمیم‌ها، گفت: پاسخ آنها یک پاسخ واحد است که در کلمه توحید، یعنی «لا اله الا الله» خلاصه می‌شود. آیت‌الله عیسی قاسم افزود: این موضع بیانگر مخالفت شدید و رویارویی آشکار با تصمیم‌های مذکور است. رژیم آل‌خلیفه اخیرا با شدت دادن به سرکوب شیعیان شماری از روحانیون برجسته را بازداشت و محاکمه کرده است. موضع آیت‌الله عیسی قاسم در شرایطی مطرح می‌شود که اختلاف میان حاکمیت بحرین و بخش‌هایی از جامعه شیعی این کشور همچنان ادامه دارد. منتقدان سیاست‌های منامه، محدودیت‌های اعمال‌شده علیه فعالیت‌های دینی و اجتماعی شیعیان و برخورد با برخی روحانیون و فعالان را نشانه تداوم فشارهای سیاسی می‌دانند. در مقابل، مقامات بحرینی این اقدامات را در چارچوب قوانین و ملاحظات امنیتی کشور توجیه کرده‌اند. عیسی قاسم که از چهره‌های برجسته مذهبی بحرین به‌شمار می‌رود، طی سال‌های گذشته نیز بارها نسبت به سیاست‌های منامه در قبال جامعه شیعی و محدودیت‌های اعمال‌شده علیه فعالیت‌های دینی و سیاسی اعتراض کرده است.