پس از انقلاب بار دیگر آیت‌ا... رسولی‌محلاتی در دفتر حضرت امام (ره)، مسؤولیت‌های متعددی به عهده گرفتند. ایشان از آن دوره هم خاطرات زیادی دارند كه بخشی از آن به برخورد حضرت امام با آیت‌ا... منتظری مرتبط است. آیت‌ا... رسولی‌محلاتی درباره این برخوردها تعریف كرده: «واقعیت این است یكی از نگرانی‌های عمده ما، برخوردهای آقای منتظری بود. ایشان معمولا سرزده نزد امام می‌آمد و بدون این‌كه ذره‌ای ملاحظه وضعیت جسمی امام را بكند، شروع به اعتراض و اشكال گرفتن می‌كرد. اغلب هم اشكالاتش مبنای درست و حسابی نداشتند. لحن آقای منتظری جسورانه بود و امام هم انصافا صبوری زیادی به خرج می‌دادند، اما در سال‌های آخر كار به جایی رسید كه تحمل امام به‌سر آمد و ایشان را از قائم‌مقامی رهبری خلع كردند.»
آیت‌ا... رسولی محلاتی هیچ قبول نداشت اخبار آن‌گونه كه باید به امام نمی‌رسید و توضیح داده مخالفان و منتقدان هم می‌توانستند به‌راحتی حرف‌هایشان را به ایشان بزنند.