رئیس قوه قضاییه طی دستوری به رئیس سازمان قضایی نیرو‌های مسلح جمع‌آوری مستندات و اقدامات قضایی مربوط به این حادثه دلخراش را مورد تاکید قرار داد.
در دستور سید ابراهیم رئیسی خطاب به بهرامی آمده است: احتراماً با عنایت به بیانیه ستاد کل نیرو‌های مسلح در خصوص حادثه تأسف بار سقوط هواپیمای اوکراینی که منجر به شهادت و جان باختن تعدادی از هموطنان و اتباع برخی کشور‌های دیگر شده است ضمن تسلیت مجدد به خانواده‌های داغدار، بدینوسیله مقرر می‌دارد: سازمان قضایی نیرو‌های مسلح در اسرع وقت با دریافت و جمع آوری مستندات مربوط به ستاد کل نیرو‌های مسلح، سپاه پاسداران انقلاب اسلامی و سازمان هواپیمایی کشور و اخذ توضیح از مقامات مسوول مطلع، نسبت به شناسایی واقعیت قضایی مقصرین بروز این حادثه ناگوار اقدام و برابر ضوابط و مقررات قانونی رسیدگی و نتیجه را به صورت مستمر به اینجانب منعکس نمایند.
همچنین محمدجعفر منتظری، دادستان کل کشور به دادستان نظامی تهران دستور بررسی فوری ماجرا را داد.
در این نامه آمده است: نظر به اطلاعیه ستاد کل نیروهای مسلح، ضمن اظهار تأثر عمیق از این حادثه دردناک و عرض تسلیت به بازماندگان داغدیده این عزیزان، ضروری‌ است سریعا و با دقت و اهتمام لازم به ماجرا ورود کرده و تحقیقات لازم برای شناسایی تمام علت و عوامل حادثه انجام و نتیجه را برای پیگیری‌های بعدی به اینجانب گزارش کنید.